Un mouvement national de tertiarisation des institutions de formation du personnel enseignant a débuté dans les années 1990. Ce mouvement répondait à un souci d’harmonisation au niveau suisse, ainsi qu’à une volonté d’élever le niveau de formation générale des enseignantes et enseignants.

La Conférence suisse des directeurs cantonaux de l’instruction publique (CDIP) a exprimé une volonté politique par la publication, en 1993, de thèses relatives à la promotion des hautes écoles pédagogiques et par l’adoption, en date du 26 octobre 1995, de recommandations relatives à la formation des enseignantes et des enseignants et aux hautes écoles pédagogiques. La HEP-PH FR succéda donc progressivement, dès 2001, à l’Ecole Normale Cantonale.

Ayant obtenu en 2005 la reconnaissance CDIP et la certification ISO en 2011, la HEP-PH FR poursuit son développement au bénéfice de la qualité de la formation des enseignant-e-s de et en réponse aux exigences de la société.

Depuis sa création, la HEP-PH-FR a formé plus de 600 enseignant-e-s.